質粒大(dà)提(tí)試劑(jì)盒(hé)的製備主要基(jī)於(yú)鹼(jiǎn)裂(liè)解法(fǎ)裂(liè)解(jiě)細(xì)胞,結(jié)合離(lí)心吸(xī)附(fù)柱(zhù)或磁(cí)珠(zhū)等材(cái)料特異性吸附質粒DNA的原(yuán)理(lǐ),以下(xià)從核心(xīn)原理(lǐ),試劑(jì)組成,操作(zuò)步驟,關鍵參數控製,製備(bèi)後檢測(cè)五(wǔ)個方麵進(jìn)行詳(xiáng)細介(jiè)紹(shào):
一,核心(xīn)原理
鹼(jiǎn)裂解法(fǎ):利用(yòng)強鹼(如NaOH)和去垢劑(如(rú)SDS)裂(liè)解細(xì)菌(jūn)細胞,釋放質(zhì)粒(lì)DNA和基(jī)因組DNA。在高(gāo)鹽和(hé)鹼(jiǎn)性條件下,基因(yīn)組DNA因分(fēn)子量大而(ér)纏結,容易變性沉澱;而質粒DNA由於(yú)其分(fēn)子(zǐ)量(liáng)小且結構緊密,能夠保持溶(róng)解狀態。
特(tè)異(yì)性(xìng)吸附(fù):通(tōng)過(guò)離心吸附柱(矽基(jī)質(zhì)材料(liào))或磁(cí)珠(zhū)等(děng),在(zài)高鹽(yán)狀(zhuàng)態下(xià)特異(yì)性地結(jié)合(hé)溶(róng)液(yè)中的(dí)質粒(lì)DNA,同時去除(chú)雜質蛋(dàn)白(bái)及細胞(bāo)中其他有機化(huà)合(hé)物。
二,試劑組成(chéng)
質粒大提(tí)試劑盒通(tōng)常包(bāo)含(hán)以下(xià)試(shì)劑:
裂(liè)解液:含有NaOH和(hé)SDS,用於(yú)裂解(jiě)細菌細胞。
中和液:含有(yǒu)醋酸(suān)或醋酸鉀(jiǎ),用(yòng)於(yú)中和裂(liè)解(jiě)液,使質(zhì)粒DNA復性(xìng)並(bìng)沉(chén)澱雜質(zhì)。
結(jié)合液:高鹽(yán)溶(róng)液(yè),用於(yú)促(cù)進質粒(lì)DNA與離心吸(xī)附柱或磁珠(zhū)的結合。
漂洗液(yè):含有乙(yǐ)醇或其他(tā)有機溶劑,用於去除(chú)離心吸(xī)附柱(zhù)或(huò)磁(cí)珠上的雜(zá)質(zhì)。
洗脫液:低(dī)鹽溶液(yè),用於(yú)從離心吸(xī)附(fù)柱或磁(cí)珠上(shàng)洗(xǐ)脫質(zhì)粒DNA。
三,操作步驟
細菌培(péi)養:將含有(yǒu)目標質粒的細菌接種(zhǒng)到適量的培養基(jī)中,過夜(yè)培(péi)養至(zhì)對(duì)數(shù)生長期(qī)。
菌體收(shōu)集:通(tōng)過離心收(shōu)集細(xì)菌菌體(tǐ),棄去(qù)上(shàng)清(qīng)液(yè)。
裂解:向(xiàng)菌(jūn)體沉澱中(zhōng)加入裂解液(yè),充分混(hùn)匀(yún)後裂解細(xì)菌(jūn)細胞(bāo)。
中和:加入(rù)中(zhōng)和液(yè),輕輕(qīng)混匀後(hòu)中和(hé)裂(liè)解(jiě)液,使(shǐ)質(zhì)粒(lì)DNA復性(xìng)並(bìng)沉澱(diàn)雜(zá)質(zhì)。
離(lí)心:通過離心(xīn)去(qù)除雜質沉澱(diàn),收集上(shàng)清液。
結合(hé):將(jiāng)上(shàng)清液(yè)加入到離(lí)心(xīn)吸附(fù)柱或含(hán)有磁珠(zhū)的(dí)試管(guǎn)中,通過離(lí)心(xīn)或磁力作(zuò)用使質粒DNA與(yǔ)離(lí)心吸附(fù)柱或(huò)磁(cí)珠結合。
漂(piāo)洗(xǐ):用漂洗(xǐ)液去(qù)除離心吸附(fù)柱或磁珠上的(dí)雜質。
洗(xǐ)脫:用洗脫(tuō)液從離(lí)心(xīn)吸附(fù)柱或磁(cí)珠(zhū)上(shàng)洗脫(tuō)質粒(lì)DNA,收集(jí)洗(xǐ)脫液即為純化(huà)的(dí)質(zhì)粒(lì)DNA溶液。
四,關鍵(jiàn)參(cān)數(shù)控製
裂解時(shí)間(jiān):裂(liè)解(jiě)時間過長(cháng)可(kě)能導致質粒DNA變性或降(jiàng)解,裂解時間(jiān)過短(duǎn)則可能(néng)導(dǎo)致裂解(jiě)不充分。因(yīn)此,需要嚴格控製(zhì)裂(liè)解時間(jiān)。
中和(hé)條件(jiàn):中和(hé)液的pH值(zhí)和離子(zǐ)強度對質(zhì)粒(lì)DNA的復性(xìng)和沉澱(diàn)雜質(zhì)有重要(yào)影(yǐng)響。需要確保中和(hé)液的pH值(zhí)和離(lí)子(zǐ)強(qiáng)度(dù)在適宜(yí)範圍(wéi)內(nèi)。
離心條(tiáo)件:離心的轉(zhuǎn)速(sù)和時(shí)間對去除(chú)雜(zá)質和收(shōu)集上清(qīng)液(yè)有(yǒu)重(zhòng)要影響。需要根據實驗需求(qiú)選(xuǎn)擇合(hé)適(shì)的(dí)離心(xīn)條件(jiàn)。
洗脫條件(jiàn):洗(xǐ)脫液(yè)的pH值和離子強(qiáng)度對(duì)洗(xǐ)脫效率有重要(yào)影響。需(xū)要確(què)保洗(xǐ)脫液的(dí)pH值(zhí)和(hé)離(lí)子強度(dù)在適宜(yí)範圍內(nèi),以提(tí)高洗(xǐ)脫效(xiào)率(shuài)。
五,製(zhì)備(bèi)後(hòu)檢測
濃度檢(jiǎn)測(cè):使用分(fēn)光(guāng)光度計(jì)檢(jiǎn)測質(zhì)粒DNA溶液(yè)的濃度,確(què)保提(tí)取的質(zhì)粒(lì)DNA量滿足實驗需(xū)求(qiú)。
純度檢(jiǎn)測:通過(guò)瓊脂(zhī)糖凝(níng)膠電泳(yǒng)或紫外分光(guāng)光(guāng)度(dù)計檢測質(zhì)粒DNA的純(chún)度(dù)。純化的(dí)質粒DNA在(zài)瓊(qióng)脂(zhī)糖凝膠電(diàn)泳中應呈現單一條帶,且(qiě)OD260/OD280比(bǐ)值應在(zài)1.7-1.9之間。